Objectif Le cancer du poumon est la principale cause de décès  par cancer au canada. Le taux de survie à 5 ans est de 17 %. La résection chirurgicale demeure le meilleur espoir curatif des patients. cependant, 30 à 50 % récidivent suite à cette intervention et aucun outil clinique n’est disponible afin de prédire les risques des patients opérés. L’objectif de ce projet est d’identifier des biomarqueurs associés à la survie suivant une résection chirurgicale d’un adénocarcinome de stade 1.

Méthodes Les gènes candidats ont été sélectionnés grâce à une revue de littérature, ainsi qu’à l’analyse de bases de données publiques (PREcOg). L’une de nos bases de données, dans laquelle l’expression des gènes a été quantifiée à l’aide de biopuces à ADN dans la tumeur et le parenchyme pulmonaire non-tumoral à 0, 2, 4 et 6 cm de la tumeur a également été analysée. L’expression des gènes a ensuite été mesurée par qPcR sur 244 échantillons d’adénocarcinomes de stade 1. Des analyses de Kaplan-Meier ont été réalisées pour évaluer leur valeur pronostique.

Résultats Dix gènes ont été sélectionnés selon leur capacité à prédire une récidive ou une rémission grâce aux données publiques. Les analyses complémentaires sur notre base de données ont permis de réduire la liste à 3 gènes associés à un mauvais pronostique (RRM1, EZH2 et FOXM1) et 2 gènes associés à un bon pronostique (BTG2, SELEnBP1). Les analyses de EZh2 et de RRM1 par qPcR ont révélées des courbes de survies significativement différentes entre les patients avec des niveaux d’expression géniques élevés et faibles EZh2 Kaplan- Meier log-rank ; p = 0,04, RRM1 Kaplan-Meier log-rank ; p = 0,0003). En revanche, celles de BTG2, SELENBP1, et FOXM1 ne montrent pas de différences significatives. Les analyses des gènes EZH2 et RRM1 sur une cohorte de validation indépendante sont en cours.

Conclusion nos résultats supportent le rôle des gènes EZh2 et  RRM1 comme biomarqueurs afin de prédire la récidive des adéno- carcinomes de stade 1.

Introduction  L’ADNtc s’est imposé comme un outil de routine  pour la détection non-invasive de la mutation de résistance EgFR T790M. Le next generation Sequencing (ngS) de l’ADntc pourrait aussi permettre la détection d’autres mutations de résistance à l’osimertinib.

Méthodes : Le plasma de pts porteurs d’adénocarcinomes mutés EgFR avec mutation T790M acquise a été prélevé de manière itérative, avant traitement, à un et 2 mois et à progression, puis testé par ngS ciblé, basé sur le séquençage d’amplicons tagués de hotspots et régions codantes de 36 gènes d’intérêt. La puissance diagnostique a été comparée au données du tissu (incluant ngS quand disponible) et du plasma (digital droplet PcR)

Résultats 94 spécimens de 26 pts ont été analysés par ngS en aveugle des résultats du tissu et de la ddPcR. Le ngS était plus sensible que la ddPcR pour la détection du driver (100 % vs 88,5 %). un seul résultat discordant entre tissu et plasma (288 gènes testés) a été observé, une mutation de PIK3CA, confirmée à posteriori par ddPcR. La concordance quantitative était haute (R = 0,94). Le driver était détectable chez 21 pts dans le plasma à résistance. Parmi 6 patients qui ont maintenu T790M, 4 ont acquis la mutation tertiaire d’EgFR c797S, deux ont acquis une mutation de KRAS. Parmi 15 pts avec perte de T790M, 7 ont acquis un autre clone de résistance : PI3KCA, KRAS, BRAF V600E (n = 2), amplification de MET, de HER2, de FgFR1. chez 3 pts, ces mutations ont pu être détectées avant initiation du traitement et ont ré-émergé à résistance. Les mutations de résistance à fraction allélique > 0,3 % ont été confirmée par ddPcR.

Conclusions Le ngS plasmatique était plus sensible que la ddPcR avec une parfaite spécificité et une excellente concordance quantitative. Le ngS de prélèvements successifs permettent de détecter chez certains patients l’émergence d’un clone compétitif de résistance de manière précoce, et pourraient permettre de guider des combinaisons de thérapies ciblées.